třída enzymů, které katalysující isomeraci sloučenin. Rozdělují se podle typu reakce na racemasy a epimerasy{EC 5.1.-.-} (změny konfigurace v jednotlivých centrech chirality), cis-trans-isomerasy{EC 5.2.-.-} (přeměny cis-isomerů na trans-), intramolekulární oxidoreduktasy (např. ketolisomerasy) a intramolekulární transferasy (přesuny skupin uvnitř jedné molekuly, tzv. mutasy). Patří sem i DNA-topoisomerasy.