enzymy, katalysátory biochemických reakcí, nejpočetnější skupina bílkovin;

membránové kanály a přenašeče, membránové bílkoviny schopné přenášet molekuly nebo ionty přes biologickou membránu (viz iontové kanály, permeasy, transferasy, štěrbinové spojení, trvalé póry);

bílkoviny transportní a skladovací, které zajišťují v organismech funkční distribuci nízkomolekulárních látek, např. myoglobin a hemoglobin transportují a skladují kyslík, ferritin a transferrin železo, sérový albumin mastné kyseliny ap.;

bílkovinné hormony a jiné regulační molekuly (viz cytokiny);

receptory, které váží signální molekuly (např. hormony); některé jsou vázány v membráně, mnohé jsou rozpuštěny v cytosolu;

bílkoviny obranného a ochranného systému, kam řadíme především protilátky (imunoglobuliny), zodpovědné za imunitní odpověď, a fibrinogen, zajišťující srážení krve a ochranu před vykrvácením;

strukturní proteiny cytoskeletu, svalu a mezibuněčné hmoty (aktin, kolagen, myosin, tubulin aj.), jejichž úkolem je vytvářet prostorovou architekturu buněk, orgánů i celých organismů, ale také přeměňovat chemickou energii na mechanickou práci a umožňovat tak pohyb.