krátký úsek jednořetězcové DNA nebo RNA, který se na principu párování basí váže k templátovému řetězci DNA; obsahuje volnou 3´-OH skupinu, na níž může DNA-polymerasa navázat další deoxyribonukleotid a zahájit tak vlastní polymerační reakci. Při iniciaci
replikace vytváří primer RNA-polymerasa (též primasa). Synthetické primery se užívají při polymerasové řetězové reakci a při sekvenování DNA Sangerovou dideoxy-metodou.