Biochemický slovník
Biochemický slovník
Procházet slovníkem pomocí tohoto rejstříku
Speciální | A | Á | B | C | Č | D | Ď | E | É | Ě | F | G | H | CH | I | Í | J | K | L | M | N | Ň | O | Ó | P | Q | R | Ř | S | Š | T | Ť | U | Ú | Ů | V | W | X | Y | Ý | Z | Ž | VŠE
S |
---|
struktura biopolymeru primárnítéž sekvence (srov. sekvenování), angl. biopolymer primary structure, pořadí monomerních stavebních jednotek (aminokyselin, nukleotidů nebo monosacharidů) v řetězci biopolymeru bez ohledu na jejich prostorové uspořádání (s výjimkou konfigurace). Konvenčně se sekvence zapisuje u bílkovin vždy od N-konce k C-konci (peptidového řetězce) a u nukleových kyselin od 5′-konce k 3′-konci; v tomto směru jsou tyto řetězce v buňkách syntetizovány. | |
struktura biopolymeru prostorovátéž prostorové uspořádání, angl. biopolymer spacial structure nebo biopolymer spacial arrangement, souhrnný pojem pro prostorové uspořádání molekuly, dané
konfigurací všech center chirality a konformací všech jednoduchých vazeb. Protože konfigurace monomerních jednotek biopolymerů je stálá (L-aminokyseliny, β-D-(deoxy)ribosa v (deoxy)nukleotidech), používá se někdy pro prostorovou strukturu pojem konformace. Jedná se o základní strukturní charakteristiku biologicky funkčního biopolymeru. Prostorové uspořádání je stabilizováno nejrůznějšími typy nekovalentních interakcí, někdy však též kovalentními příčnými vazbami (např. disulfidovými vazbami v bílkovinách). Při jeho popisu rozlišujeme několik úrovní: strukturu sekundární, supersekundární, doménovou, terciární a kvarterní. | |
struktura biopolymeru sekundárníangl. biopolymer secondary structure, popis prostorových vztahů sousedních nebo blízkých částí polymerního řetězce; jiná definice: uspořádání hlavního řetězce biopolymeru bez ohledu na strukturu postranních řetězců a na vztahy k jiným molekulám. Sekundární struktura bývá často periodická (viz bílkoviny − strukturní motivy, dihelix DNA, šroubovicová struktura amylosy). | |
struktura biopolymeru supersekundárníangl. biopolymer supersecondary structure, struktura vytvářená interakcemi mezi jednotlivými periodicky uspořádanými částmi jediného polymerního řetězce (u bílkovin motivy αα, αβα, několik úseků
β-struktury apod.). | |
struktura biopolymeru terciárníangl. biopolymer tertiary structure, uspořádání všech atomů molekuly v prostoru bez ohledu na vztahy k ostatním molekulám; jde tedy o popis prostorových vztahů vzdálených částí polymerního řetězce, jakož i popis celkového tvaru molekuly. Pokud je molekula součástí nadmolekulové struktury či má kvarterní strukturu, máme zde na mysli strukturu určité podjednotky. | |
struktura nadmolekulovátéž supramolekulární struktura, angl. supramolecular structure, organizovaná komplexní biologická struktura vytvořená několika (často mnoha) podjednotkami. Typickými představiteli nadmolekulových struktur jsou rafty biologických membrán (polární lipidy + membránové bílkoviny + cholesterol), ribosomy (rRNA + ribosomální bílkoviny), chromosomy eukaryot (DNA + histony + další bílkoviny), složky cytoskeletu (mnohonásobně se opakující bílkovinné podjednotky) či virové částice (DNA nebo RNA + bílkoviny + polární lipidy). | |
substrátangl. substrate, pojem užívaný v enzymologii pro látku vstupující do reakce (chemicky vyjádřeno reaktant). Například substráty reakce katalyzované enzymem
invertasou (sacharosa + H2O → glukosa + fruktosa), jsou sacharosa a voda. Podle počtu substrátů pak dělíme enzymové reakce na
| |
substrát chromogenníangl. chromogenic substrate, bezbarvá nebo téměř bezbarvá látka, která se enzymovou reakcí přeměňuje na látku barevnou, z řeckého
chroma = barva a genos = rodit, tedy látka rodící barvu. Chromogenní substráty se běžně využívají při spektrofotometrickém stanovení katalytické aktivity enzymových preparátů: přidá se chromogenní substrát a měří se intenzita vznikajícího zabarvení (tedy rychlost růstu absorbance). | |
Südhof Thomas Christianlékař a biochemik (nar. 1955), Nobelova cena (za fyziologii a lékařství, 2013) za studii regulace vesikulárního transportu (spolu s J. E. Rothmanem a R. W. Schekmanem). Narodil se v Göttingen (Německo), kde vystudoval lékařství; doktorát získal z biofyzikální chemie. Od roku 1983 trvale žije v USA; má německé i americké občanství. Celoživotně se zabývá přenosem látek a informace buněčnými membránami (přenos cholesterolu obsaženého v LDL do buněk, uvolňování adrenalinu, noradrenalinu a endorfinů z buněk dřeně nadledvin či transport neurotransmiterů z presynaptických buněk do synaptické štěrbiny). Jeho výzkumy podstatným způsobem přispěly k pochopení vzniku Alzheimerovy choroby, Parkinsonovy nemoci, schizofrenie, úzkostné poruchy a autismu. | |
sukcinyl-koenzym A | |