Biochemický slovník

angl. hydrophility, vlastnost molekul nebo jejich částí, která jim umožňuje energeticky výhodně interagovat s vodou.Protože molekuly vody mohou být donory i akceptory vodíkových můstků a tvoří permanentní dipóly, mohou s nimi další molekuly interagovat především prostřednictvím vodíkových můstků a interakcí ion–dipól a dipól–dipól. Hydrofilitou molekul se vysvětluje dobrá rozpustnost oligosacharidů, polárních aminokyselin a polynukleotidů ve vodě. Srov. hydrofobicita.

angl. hydrophobicity, vlastnost molekul nebo jejich částí, která se projevuje neochotou interagovat s vodou (strachem z vody). Hydrofobní molekuly se jen nesnadno rozpouštějí ve vodě. U amfipatických molekul, které obsahují hydrofobní a hydrofilní části, dochází k tomu, že se hydrofobní části shlukují a vytvářejí micely obklopené hydrofilními skupinami, které s vodou interagují ochotně. Hydrofobicitu molekul lze kvantifikovat měřením rozdělovacích koeficientů látek mezi vodu a s ní nemísitelným rozpouštědlem, nejčastěji 1-oktanolem (srov. hydrofilita, viz interakce hydrofobní).

angl. hydrolases, třída enzymů (EC 3.-.-.-) katalyzujících hydrolytické štěpení vazeb, které vznikly nebo mohly vzniknout kondenzací molekul za odštěpení vody (A-B + H₂O  A-OH + HB). Jejich systémový název je substrát(skupina)hydrolasa; skupina se uvádí, pokud není jednoznačné, která část z molekuly substrátu se hydrolyticky odštěpuje. Tak peptidasy a proteasy (proteinasy) štěpí peptidové vazby, glykosidasy (např. amylasy) vazby glykosidové, esterasy (např. lipasy, fosfolipasy a fosfatasy) vazby esterové atd. Jedná se o nejpočetnější třídu enzymů, které plní řadu biochemicky nezastupitelných funkcí (trávení, hemokoagulace pomocí thrombinu, regulace aktivity enzymů pomocí fosfatas, posunování rovnováhy reakcí štěpením difosfátu, realizace endergonických procesů zajišťovaná ATPasami atd.).

angl. hydrolyases, enzymy katalyzující odštěpení molekuly vody za vzniku dvojné vazby nebo naopak adici vody na dvojnou vazbu (EC 4.2.1.-). K důležitým reakcím tohoto typu patří např. přeměna 2-fosfoglycerátu na fosfoenolpyruvát v glykolyse, enoyl-CoA na 3-hydroxyacyl-CoA při β-oxidaci mastných kyselin nebo adice vody na fumarát za vzniku L-malátu v citrátovém cyklu.

angl. hydrolysis, energeticky výhodné štěpení molekul (glykosidů, esterů, amidů, anhydridů atd.) reakcí s vodou. Vzhledem k tomu, že aktivační energie těchto reakcí jsou vysoké, hydrolýza mnoha biologicky důležitých látek za běžných teplot a pH neprobíhá; existuje však mnoho významných hydrolas, které hydrolýzu umožňují a kineticky řídí.

angl. total hydrolysis of proteins, metoda úplného štěpení bílkovin na aminokyseliny in vitro. Obvykle se provádí při zvýšené teplotě a tlaku (24 hodin, 110 °C) v prostředí kyseliny chlorovodíkové (kyselá hydrolýza) nebo hydroxidu barnatého (alkalická hydrolýza). Totální hydrolýza je prvním krokem pro určení aminokyselinového složení bílkoviny nebo peptidu; koncentrace jednotlivých uvolněných aminokyselin se pak určuje po jejich chromatografickém rozdělení.

angl. hydroxylases, enzymy ze třídy oxidoreduktas, podskupiny oxygenas, které katalyzují zavedení hydroxylu (přeměnu vazby C-H na C-OH) do molekuly substrátu. Významně se podílejí na biotransformacích xenobiotik (viz cytochrom-P450), posttranslační modifikaci kolagenu za vzniku hydroxyprolinu a hydroxylysinu, přeměně fenylalaninu na tyrosin atd.

angl. hydroxylysine, přesněji 5-hydroxylysin nebo δ-hydroxylysin, neproteinogenní aminokyselina, vzniklá posttranslační modifikací lysinového zbytku; vyskytuje se v některých typech kolagenu.

angl. hydroxymethyltransferases, enzymy ze třídy transferas (EC 2.1.2.-), které přenášejí hydroxymethylovou skupinu. Jako donor této skupiny (koenzym) jim slouží tetrahydrofolát. Mezi nejdůležitější reakce tohoto typu patří vratná konverse L-serinu na glycin.