Biochemický slovník
Biochemický slovník
Speciální | A | Á | B | C | Č | D | Ď | E | É | Ě | F | G | H | CH | I | Í | J | K | L | M | N | Ň | O | Ó | P | Q | R | Ř | S | Š | T | Ť | U | Ú | Ů | V | W | X | Y | Ý | Z | Ž | VŠE
D |
---|
DNA-topoisomerasyangl. DNA-topoisomerases, enzymy umožňující přechod dvouřetězcové DNA z jednoho prostorového uspořádání do druhého, a to tak, že přeruší vlákno DNA, umožní daný přechod a vlákno opět spojí.
DNA-topoisomerasy typu I (EC 5.6.2.1) přerušují pouze jeden řetězec, DNA-topoisomerasy typu II (gyrasy, EC 5.6.2.2) přerušují oba řetězce a spojují je za účasti ATP. DNA-topoisomerasy se uplatňují zejména při replikaci DNA a při změnách nadšroubovicového pnutí cyklické DNA (plasmidů apod.). | |
doba generačníangl. generation time, čas, za který se zdvojnásobí počet buněk v daném objemu kultivačního media; pojem užívaný především v mikrobiologii. Je mírou životaschopnosti buněk za daných podmínek. U
bakterií se za příhodných podmínek pohybuje mezi 20 a 30 minutami. | |
Doisy Edward Adelbertamerický biochemik (1893–1986), Nobelova cena (za fyziologii a lékařství, 1943) za objev chemické struktury vitaminu K (spolu s H. C. P. Damem). V období 1922–1934 se podílel na vývoji metod umožňujících výzkum pohlavních hormonů. Spolu se spolupracovníky izolovali několik ženských hormonů, především estron (první estrogen, který se podařilo vykrystalovat), estriol a estradiol. V letech 1936–39 izoloval dvě formy vitaminu K (z vojtěšky a rybího oleje), určil jejich strukturu a podařilo se mu je i syntetizovat. Podílel se také na rozvoji metod izolace a identifikace insulinu a významně přispěl k pochopení funkce antibiotik, pufrových systémů krve a metabolismu žlučových kyselin. | |
dolicholfosfátangl. dolichol phosphate, fosforečný ester isoprenoidního alkoholu dolicholu. Hydrofobní uhlovodíková část se výborně rozpouští v membránách; u eukaryot je obsažen zejména v membráně endoplasmatického retikula. Na jeho fosfátové skupině se může postupně syntetizovat rozvětvená oligosacharidová struktura, která po přenesení na asparaginový zbytek bílkoviny slouží jako základ pro výstavbu N-vázaných glykoproteinů. | |
doména proteinováangl. protein domain, část molekuly bílkoviny, která je prostorově uspořádána víceméně nezávisle na zbytku molekuly; v tomto případě hovoříme o
strukturní doméně. V případě, že doména má vyhraněnou funkci, hovoříme o doméně funkční. U enzymů se setkáváme s funkčními doménami, které jsou schopny samostatně vázat určitý substrát; např. většina dehydrogenas, zajišťujících přenos vodíku na koenzym, má pro tento substrát funkční vazebnou doménu. | |
dopaminangl. dopamine, biogenní amin vznikající dekarboxylací a současnou hydroxylací tyrosinu (EC 1.14.16.2, vzorec viz katecholaminy); plní funkci hormonu a neurotransmiteru. | |
Doudna Jennifer Anneamerická biochemička (nar. 1964), Nobelova cena (chemie, 2020) za vývoj metody pro úpravu genomu metodou CRISPR/Cas9 (spolu s E. M. Charpentier). Narodila se na Havaji, vystudovala chemii a později spolupracovala s předními biochemiky své doby (J. W. Szostak, T. R. Cech a další). V roce 2012 společně s E. M. Charpentier a dalšími kolegy objevila způsob, jak experimentálně zjednodušit editaci DNA. Její objev byl založen na bakteriálním proteinu označovaném Cas9, který spolupracuje s naváděcí RNA a funguje podobně jako nůžky. Protein napadá virovou DNA a zkracuje ji, čímž chrání bakterii před infekcí. Tento systém byl znám již dříve, ale J. Doudna a E. Charpentier se podařilo využít různé RNA k programovanému sestřihu a editaci různých typů DNA. | |
dráha metabolickáangl. metabolic pathway, sled chemických reakcí, vedoucí od prekursoru ke koncovému metabolitu. Podle tvaru dělíme dráhy na tři obecné typy:
| |
dráhy amfibolickéangl. amphibolic pathways, metabolické dráhy, které slouží jak ke
katabolismu, tak k anabolismu. Typickým zástupcem těchto drah je citrátový cyklus. Podobně pentosový cyklus slouží (anabolicky) k syntéze pentos (stavebních kamenů nukleotidů, a tím i nukleových kyselin), jeho hlavním úkolem je však katabolické odbourávání glukosy a zisk NADPH. | |
dráhy anaplerotickéangl. anaplerotic pathways, metabolické sekvence, které slouží k doplňování meziproduktů cyklických drah (viz cyklus metabolický), zejména citrátového cyklu. Příkladem jednoduché anaplerotické reakce je karboxylace pyruvátu na oxalacetát (počáteční fáze glukogenese); složitějším dějem je glyoxylátový cyklus, který syntetizuje čtyřuhlíkaté meziprodukty citrátového cyklu z dvouuhlíkatých produktů β-oxidace mastných kyselin. | |