Biochemický slovník

též Krebsův cyklus, cyklus trikarboxylových kyselin nebo cyklus citronové kyseliny, angl. Krebs cycle, hlavní křižovatka anabolických a katabolických cest aerobního metabolismu. Jeho sumární rovnice

Napojení citrátového cyklu na další metabolické děje

Meziprodukt citrátového cyklu	Napojení
citrát	transport z mitochondrie do cytosolu a tam štěpení na acetyl-CoA a oxalacetát (při syntéze mastných kyselin ze sacharidů, viz pyruvát-malátový cyklus)
isocitrát	štěpení na sukcinát a glyoxylát (vstupní reakce glyoxylátového cyklu); oxidační dekarboxylace pomocí NADP+ (syntéza NADPH v mitochondrii)
2-oxoglutarát	sběrač aminoskupin při transaminacích (přeměna na glutamát); syntéza glutamátdehydrogenasovou reakcí; může přecházet vnitřní membránu mitochondrie (viz malát-aspartátové kyvadlo)
sukcinyl-CoA	výchozí metabolit pro syntézu hemu
sukcinát	produkt glyoxylátového cyklu
fumarát	produkt močovinového cyklu; produkt deaminace asparagové kyseliny
malát	může procházet vnitřní membránu mitochondrie (viz malát-aspartátové kyvadlo); oxidační dekarboxylace za vzniku pyruvátu a NADPH (viz pyruvát-malátový cyklus, cyklus C4-rostlin)
oxalacetát	přeměna na aspartát transaminací, vznik z pyruvátu karboxylací (viz glukogenese), přeměna na pyruvát dekarboxylací

angl. Cori cycle, komplexní proces, při němž je laktát, vznikající glykolysou (především v erytrocytech nebo za anaerobních podmínek ve svalech), transportován krví do jater, kde je z něho procesem glukogenese syntetizována glukosa. Ta je opět krví dopravována do tkání, které trvale (erythrocyty) nebo dočasně (svaly) nemohou využívat dýchací řetězec. V játrech je část laktátu aerobně odbourána, čímž se získá ATP, potřebný pro glukogenesi.

(psáno C₄-rostlin) též Hatchův–Slackův–Kortschackův cyklus [hečúv, slekúv, kortčakúv], angl. C₄-acid cycle, cyklus reakcí při fotosyntetické asimilaci oxidu uhličitého u C₄-rostlin a u CAM-rostlin. Cyklus zahrnuje navázání CO₂ na akceptor (fosfoenolpyruvát) a vznik sloučenin se čtyřmi atomy uhlíku (oxalacetát, proto C₄), sloužících k transportu navázaného CO₂ do buněk, které nejsou v přímém kontaktu s ovzduším (u C₄-rostlin), nebo k jeho uložení do zásoby ve vakuolách (malát u CAM-rostlin). Z těchto látek se pak řízeně uvolňuje CO₂, který je využíván reakcemi Calvinova cyklu; vznikající pyruvát slouží k regeneraci primárního akceptoru (fosfoenolpyruvátu), čímž se cyklus uzavírá. Řízeným uvolňováním CO₂ se, ve srovnání s C₃-rostlinami, zvyšuje jeho koncentrace (přesněji parciální tlak) v buňkách, kde probíhá temná fáze fotosyntézy, což zlepšuje jeho využití, neboť snižuje podíl fotorespirace. Rostliny s tímto, z hlediska hospodaření s CO₂ výhodným, typem metabolismu (např. kukuřice, cukrová třtina, ananasovník) vyžadují vysokou ozářenost, neboť v temné fázi spotřebovávají více ATP než C₃-rostliny.

angl. glyoxylate cycle, anaplerotická dráha, sloužící k syntéze sacharidů z dvouuhlíkatých sloučenin (z aktivovaného acetátu):

též ureogenetický, ornithinový nebo Krebsův–Henseleitův cyklus, angl. urea cycle. Slouží u placentárních savců k eliminaci vysoce toxického amoniaku, který vzniká především odbouráváním aminokyselin (produkty katabolismu bílkovin). Zdrojem jednoho atomu dusíku v molekule močoviny je zde volný amoniak, zdrojem druhého je aminokyselina L-aspartát (asparagová kyselina):

též pentosafosfátová cesta, fosfoglukonátová cesta nebo hexosamonofosfátový zkrat, angl. pentose cycle nebo pentose phosphate pathway, komplexní děj, jehož hlavním účelem je získat pro buňku redukční ekvivalenty v podobě NADPH. V první fázi, zvané oxidační, je výchozí metabolit, glukosa-6-fosfát, dvěma dehydrogenačními kroky převeden na ribulosa-5-fosfát (viz obr.):

angl. pyruvate-malate (nebo pyruvate/malate) cycle, složitý proces, pomocí něhož je z pyruvátu v cytosolu syntetizován acetyl-CoA a současně se získává NADPH. Část děje probíhá v mitochondrii. Sumární rovnici, kde c značí cytosol a m mitochodrii, lze zapsat:

též psuedocyklus, angl. futile cycle, sekvence reakcí, které mohou vytvářet metabolický cyklus, obvykle však cyklicky neprobíhají, protože celkový zisk užitečné práce by neodpovídal spotřebované energii. Typickým příkladem takového děje je fosforylace fruktosa-6-fosfátu, známá z glykolysy, a hydrolytické štěpení vznikajícího fruktosa-1,6-bisfosfátu, probíhajícího ve stejném kompartmentu (cytosolu) při glukogenesi. Sumárním dějem je tedy štěpení ATP. Za běžných okolností obě reakce neprobíhají současně, neboť jeden z enzymů je vždy inhibován. Některé buňky však využívají tohoto cyklu na produkci tepla.

Cys nebo C, angl. cysteine, proteinogenní glukogenní aminokyselina. Může být syntetizován ze serinu, přičemž dodavatelem atomu síry je esenciální aminokyselina methionin; Cys je tedy podmíněně esenciální. Obsahuje thiolovou skupinu (-SH), která je velmi reaktivní a snadno se oxiduje za vzniku disulfidové vazby. Skupina SH dodává postrannímu řetězci Cys polární charakter; disociuje již ve slabě alkalickém prostředí (pK_a≈ 8). Cys je součástí tripeptidu glutathionu, který se podílí na řadě intracelulárních oxidačně-redukčních reakcí. Dekarboxylací Cys vzniká významný biogenní amin cysteamin (viz koenzym A). Skupina SH cysteinu je součástí aktivního místa některých proteolytických enzymů (označují se cysteinové neboli SH-proteasy, EC 3.4.22.-; EC 3.4.18.-)