Biochemický slovník
Biochemický slovník
| Všechny kategorie |
ÚROVEŇ BIOCHEMIE II |
|---|
pyridoxinangl. pyridoxine, viz vitamin B6. | |
pyrolysintéž pyrrolysin, Pyl nebo U, angl. pyrrolysine, vzácná bazická aminokyselina | |
objevená r. 2002 v určitých radiace fotosynteticky aktivníangl. photosynthetically active radiation, PAR, oblast záření aktivního při
fotosyntéze určitého organismu. Pro rostlinné buňky je to oblast viditelného záření (400 až 500 nm a 600 až 700 nm), fototrofní bakterie využívají záření až do vlnových délek 1 000 nm. Absorpce záření určité vlnové délky fototrofním organismem je závislá na struktuře a obsahu fotosyntetických pigmentů a na anatomické struktuře fotosyntetického orgánu (nejčastěji listu). | |
radikál hydroxylovýOH•, angl. hydroxyl radical, jedna z reaktivních kyslíkových částic, způsobujících oxidační stres. Vzniká především jednoelektronovou redukcí peroxidu vodíku: H2O2 + e− + H+→ OH• + H2O. | |
radikál superoxidovýO2−•, angl. superoxide radical, jedna z reaktivních kyslíkových částic způsobujících oxidační stres. Vzniká jednoelektronovou redukcí molekulového kyslíku. Je odstraňován enzymem superoxiddismutasou. | |
rafty membránovétéž membránové mikrodomény, angl. membrane rafts (raft = vor), uspořádané oblasti v biologické membráně eukaryotních buněk. Obsahují cholesterol, sfingolipidy a příslušné bílkoviny a zajišťují některé specifické funkce. Lipidy v těchto oblastech tedy mají omezenou laterální pohyblivost, membrány jsou zde silnější a tužší. | |
rámec čtecí | |
rámec čtecí otevřenýangl. open reading frame, ORF, deoxyribonukleotidová sekvence ohraničená z jedné strany kodonem pro methionin (nebo jiným iniciačním kodonem) a z druhé strany STOP-kodonem; pojem užívaný při in silico analýze genomové DNA u prokaryot nebo cDNA u eukaryot. Každou nukleotidovou sekvenci lze přeložit do šesti různých aminokyselinových sekvencí (tři v jednom směru vždy posun začátku čtení tripletů o jednu bázi a tři analogicky v druhém směru) a v každé z nich můžeme ORF nalézt. Porovnáním získaných variant ORF s databázemi můžeme identifikovat, zda daný ORF představuje gen kódující protein. Na obrázku je příklad překladu ve všech šesti čtecích rámcích s vyznačením sekvencí odpovídajících otevřeným čtecím rámcům (červeně), přičemž za sekvenci kódující protein lze (díky její délce) považovat pouze červený úsek v horní části obrázku (5′-3′-Frame 1).  | |
reakce polymerasová řetězováangl. polymerase chain reaction, PCR, technika umožňující získat velké množství kopií určité sekvence
DNA. Cyklicky se opakuje teplotní denaturace (t ≈ 95 °C), při níž se rozpadá dvouřetězcová DNA na samostatné řetězce, a replikace, při níž vzniklé jednotlivé řetězce DNA slouží jako templáty pro DNA-polymerasu (t ≈ 70 °C). Pro iniciaci replikace musí být nejdříve připojeny primery (t ≈ 50 °C); jejich struktura rozhoduje o tom, kde replikace začne a který úsek DNA tedy bude namnožen. Počet kopií tohoto úseku roste exponenciálně s počtem cyklů (proto "řetězová rekce"). Za objev polymerasové řetězové reakce získal K. B. Mullis roku 1993 Nobelovu cenu.  | |
receptor tyrosinkinasovýangl. receptor tyrosin kinases (RTKs), skupina receptorů s vlastní tyrosinkinasovou aktivitou. Nacházejí se v buněčné membráně. Po vazbě ligandu (například insulinu) na tento receptor dojde k aktivaci tyrosinkinasové domény receptoru uvnitř buňky a fosforylaci tyrosinových zbytků v této části molekuly. Takto aktivovaný receptor pak může fosforylovat další intracelulární enzymy, které se tak aktivují a spouštějí kaskádu reakcí v odpovědi na vazbu ligandu na receptor (viz transdukce signálu).  | |