Biochemický slovník
Biochemický slovník
Procházet slovníkem pomocí tohoto rejstříku
Speciální | A | Á | B | C | Č | D | Ď | E | É | Ě | F | G | H | CH | I | Í | J | K | L | M | N | Ň | O | Ó | P | Q | R | Ř | S | Š | T | Ť | U | Ú | Ů | V | W | X | Y | Ý | Z | Ž | VŠE
V |
|---|
vazba vodíková též (méně vhodně) vodíkový můstek, angl. hydrogen bond nebo hydrogen bridge, nekovalentní spojení dvou elektronegativních atomů sdílením atomu vodíku (resp. protonu). Jeden z elektronegativních atomů působí jako donor (původněnesl vodíkový atom) a druhý jako akceptor. V biochemii jsou vodíkové vazby mimořádně důležité při přenosu genetické informace (viz komplementarita bází), při stabilizaci prostorové struktury bílkovin a při rozpoznávání partnerů v interakcích enzym-substrát, enzym-inhibitor, receptor-ligand apod. Podmiňují též hydrofilní vlastnosti skupin, které vytvářejí vodíkové vazby s molekulami vody. Na obrázku jsou čárkovaně vyznačeny vodíkové vazby mezi dusíkovými (donory, modré) a kyslíkovými (akceptory, červené) atomy v polypeptidu v α-helikálním uspořádání. | |
vazba zpětná negativníangl. negative feedback nebo negative inhibition, v biochemii mechanismus, jímž je tok látek určitou metabolickou drahou regulován
inhibicí klíčového enzymu (nebo klíčových enzymů) koncovými produkty této dráhy (viz inhibice enzymů koncovým produktem metabolické dráhy). Obecněji je to regulace úrovně jakéhokoliv faktoru citlivého na svou vlastní intenzitu, známého z fyzikální chemie jako LeChatelierův princip. Tímto způsobem jsou regulovány hladiny hormonů, koncentrace iontů, teplota a mnoho dalších faktorů (viz homeostáza, příklad negativní zpětné vazby při syntéze hormonu viz kortizol). | |
vektorangl. vector, v genovém inženýrství molekula DNA, do níž může být inkorporována určitá sekvence deoxyribonukleotidů (např. gen) a která může být následně vnesena do buňky, jež pak vnesenou sekvenci uchovává, replikuje a realizuje (např. proteosyntézou). Jako vektory se používají plasmidové nebo virové DNA. | |
vidlice replikačnítéž replikační vidlička, angl. replication fork, úsek
DNA ve tvaru písmene Y, v němž probíhá synteza řetězců DNA; dvě replikační vidlice ohraničují replikační očko. Při replikaci se vidlice posunuje (při analogii s písmenem Y směrem dolů) a dvouřetězcová (mateřská) DNA se postupně otvírá tak, jak jsou syntetizovány dceřinné řetězce. | |
viryangl. viruses, nebuněčně organizované formy živé hmoty. Virová partikule vždy obsahuje
nukleové kyseliny (DNA nebo RNA), které jsou chráněny bílkovinným obalem. Viry jsou obligátní buněční parazité; při své replikaci využívají syntetický aparát hostitelské buňky. Jsou nejčastějšími původci infekčních onemocnění rostlin a živočichů (viróz), napadají však i jednobuněčné organismy (bakteriofágy). | |
vitálangl. vital, zkrácená forma výrazu "vitální indikace laboratorního vyšetření". Užívá se pro označení vzorku při akutním ohrožení života pacienta, kdy výsledek vyšetření má zásadní význam pro určení dalšího léčebného postupu. Vzorky se zpracovávají neprodleně po přijetí do laboratoře s absolutní předností před všemi ostatními (srov. statim). | |
vitamin Atéž retinol, angl. retinol, isoprenoidní vitamin rozpustný v tucích, jeho provitaminy jsou některé karotenoidy. Retinol  se vyskytuje především v živočišných produktech (v mléce, másle, rybím oleji). Jeho dehydrogenační produkt 11-cis-retinal se v buňkách sítnice (retina) váže na bílkovinu opsin, čímž vzniká složená bílkovina rhodopsin, který má zásadní význam v biochemii vidění: absorpce světla retinalem je spojena s konformační změnou opsinu a následnou sérií molekulových událostí, které vedou ke změně membránového potenciálu světločivné buňky a vzniku nervového vzruchu vnímaného mozkem jako optický vjem. cis-Retinal po absorpci světla isomeruje na formu trans, která je řadou následných enzymových reakcí zpětně převedena na aktivní cis-retinal. Nejdůležitějším příznakem nedostatku vitaminu A je proto šeroslepost a vysychání očních tkání (xeroftalmie, odtud starší název axeroftol). Pomáhá také udržovat strukturu sliznic a kůže, napomáhá hojení ran, vředů a popálenin, zvyšuje obranyschopnost organismu proti infekčním onemocněním, podílí se na  tvorbě zubní a kostní tkáně. | |
vitamin B1
| |
též thiamin nebo aneurin, angl. thiamine, ve vodě rozpustný vitamin B12též kobalaminy, angl. cobalamines, skupina derivátů korinu tvořených kruhovou strukturou čtyř pyrrolových jader  (podobnost s hemem) s centrálně navázaným iontem kobaltu a nukleotidovou složkou s 5,6-dimethylbenzimidazolem jako bází. Na iontu kobaltu je koordinačně-kovalentní vazbou navázán další ligand (voda, OH−, methylová skupina, deoxyadenosin nebo kyanid – skupina R na obrázku). Je prostetickou skupinou některých důležitých enzymů, účastní se zejména přenosu methylové skupiny a některých isomeračních reakcí. Získává se z přírodních zdrojů extrakcí. Podává se v injekční formě, neboť jeho nedostatek v organismu je velmi často způsoben nedostatkem vnitřního faktoru (angl. intrinsic factor), bílkoviny, která umožňuje jeho průchod žaludeční či střevní stěnou. Ukládá se ve velkém množství především v játrech. Jeho nedostatek (hypovitaminóza) se nejdříve projevuje nervovými bolestmi a snížením citlivosti v končetinách, avitaminóza pak zhoubnou chudokrevností. Za určení této mimořádně složité struktury pomocí rentgenkrystalografické analýzy získala D. C. Hodgkinová Nobelovu cenu. | |
vitamin B2též riboflavin, angl. riboflavin, ve vodě rozpustný žlutý vitamin obsažený  především v droždí, mase a mléčných výrobcích. Je složen z dusíkatého heterocyklu isoalloxazinu a cukerného alkoholu ribitolu. V aktivní podobě flavinadeninmononukleotidu (FMN) a flavinadenindinukleotidu (FAD) je prostetickou skupinou řady enzymů třídy oxidoreduktas. Jeho nedostatek se projevuje různými kožními defekty a poruchami vidění. Užívá se jako součást vitaminových doplňků lidské i veterinární výživy a jako přirozené barvivo potravin. | |