Biochemický slovník

Trp nebo W, angl. tryptophan, aromatická esenciální ketogenní proteinogenní aminokyselina. Jeho objemný postranní řetězec je významnou strukturní součástí bílkovin. Má význačné fluorescenční vlastnosti, čehož se využívá při studiu prostorového uspořádání okolí jeho indolové skupiny. Ačkoliv je v bílkovinách poměrně málo zastoupen, je velmi významný z hlediska výživy. Je prekursorem několika důležitých látek: nikotinamidu (viz niacin) a biogenních aminů tryptaminu a serotoninu.

angl. tubulin, snadno polymerující globulární bílkovina, strukturní základ mikrotubulů cytoskeletu.

angl. lipids, triviální označení triacylglycerolů, v technologii se někdy rozlišují tuky (za pokojové teploty pevné, s vyšším obsahem nasycených mastných kyselin) a oleje (kapalné).

Tyr nebo Y, angl. tyrosine, aromatická proteinogenní ketogenní aminokyselina, podmíněně esenciální (vzniká hydroxylací esenciální aminokyseliny fenylalaninu). Je prekursorem řady významných látek především hormonální povahy: katecholaminů (dopaminu, noradrenalinu a adrenalinu) a hormonů štítné žlázy (trijodtyroninu a thyroxinu); jeho dekarboxylačním produktem je biogenní amin tyramin. Jeho fenolová hydroxylová skupina může být fosforylována působením protein-tyrosin kinas (EC 2.7.10.-); tato modifikace je významným prostředkem regulace aktivity řady enzymů, ukazuje se, že mnoho onkogenů kóduje právě tento typ kinas (viz tyrosinkinasové receptory). Fenolová skupina OH má vlastnosti slabé kyseliny; při pH vyšším než přibližně 10 disociuje za vzniku fenolátového iontu.

angl. ubiquitin, vysoce konzervativní (konzervovaná) malá bílkovina (76 aminokyselinových zbytků) přítomná ve všech eukaryotních organismech. Váže se svým C-koncovým karboxylem na ε-aminoskupiny lysinu v postranním řetězci bílkovin a označuje je tak pro další odbourání proteasomem. Pro rychlost značení ubiquitinem (a tím i pro rychlost odbourávání intracelulárních bílkovin) je rozhodující druh aminokyseliny vázané na N-konci polypeptidového řetězce. Za objev ubiquitinem zprostředkovaného odbourávání proteinů získali roku 2004 A. Hershko, I. Rose a A. Ciechanover Nobelovu cenu.

přesněji uridin-difosfoglukosa, angl. UDP-glucose, aktivovaná forma α-D-glukosy, využívaná zejména při glykogenesi a biosyntéze sacharosy a celulosy. Vzniká reakcí:
glukosa-1-fosfát + UTP → UDP-glukosa + PP_i. Za objev cukerných nukleotidů a jejich role v biosyntéze sacharidů obdržel roku 1970 L. F. Leloir Nobelovu cenu.

též torzní nebo diedrální úhel, angl. dihedral angle, úhel umožňující kvantitativně popsat konformaci jednoduché vazby mezi atomy B a C jakožto úhel svíraný rovinami, v nichž leží atomy ABC a BCD (viz obr.). Dihedrální úhly nabývají hodnot –180° až +180° (úhlových stupňů).

angl. uniport, typ transportu částice biologickou membránou pomocí integrální membránové bílkoviny (viz permeasy), při němž se přenáší pouze jediná částice; srov. antiport a symport, kde se přenášejí částice dvě.

angl. uracil, pyrimidinová báze nukleových kyselin (2,6-dihydroxypyrimidin), která je součástí ribonukleových (nikoliv deoxyribonukleových) kyselin (srov. thymin). Komplementárně se váže s adeninem.