3 CH3–CO–SCoA + 2 (NADPH + H+) + 3 ATP + 2 H2O → CH2=C(CH3)–CH2–CH2–O–PP + CO2 + 3 ADP + Pi + 2 NADP+ + 3 HSCoA
Opakovanou kondenzací isopentenyldifosfátu a jeho isomeru, dimethylallyldifosfátu, provázenou odštěpením PPi, vznikají kostry všech isoprenoidních struktur, které pak mohou procházet dalšími úpravami (cyklizacemi, hydroxylacemi, hydrogenacemi apod.).