angl. proteins – functional classification, poněkud násilné, leč velmi užitečné dělení bílkovin; jedna molekula proteinu může totiž současně vykonávat i několik z vyjmenovaných činností. Tímto způsobem obvykle dělíme bílkoviny na:
enzymy, katalyzátory biochemických reakcí, nejpočetnější skupina bílkovin;
strukturní proteinycytoskeletu, svalu a mezibuněčné hmoty (aktin, kolagen, myosin, tubulin aj.), jejichž úkolem je vytvářet prostorovou architekturu buněk, orgánů i celých organismů, ale také přeměňovat chemickou energii na mechanickou práci a umožňovat tak pohyb.