angl. isomerases, enzymy katalyzující isomeraci sloučenin (EC 5.-.-.-). Rozdělují se podle typu reakce na racemasy a epimerasy (EC 5.1.-.-), cis-trans isomerasy (EC 5.2.-.-), intramolekulární oxidoreduktasy (např. ketolisomerasy, EC 5.3.-.-), intramolekulární transferasy (přesuny skupin uvnitř jedné molekuly, mutasy, EC 5.4.-.-), intramolekulární lyasy (EC 5.5.-.-) a isomerasy měnící konformaci makromolekul (EC 5.6.-.-, např. DNA-topoisomerasy, aktomyosinový komplex, ATPasa proteasomu, dynein). Typ reakce se objevuje i v systémovém názvu (substráttyp); proto je zde často doporučený název shodný s názvem systémovým.