angl. DNAsequencing, klasicky se provádí Sangerovou dideoxy-metodou. Při ní se využívá biosyntetické reakce katalyzované DNA-polymerasou. Do reakční směsi obsahující sekvenovanouDNA se vedle potřebných deoxyribonukleosidtrifosfátů (viz replikace) přidává malé množství určitého dideoxyribonukleosidtrifosfátu (např. ddCTP); pokud je ddCMP zařazen do řetězce, syntéza se ukončí. Vznikne tak řada různě dlouhých řetězců, které všechny končí ddCMP; tyto řetězce se rozdělí gelovou kapilární elektroforézou podle své molekulové hmotnosti. Pokus se provede pro všechny čtyři dideoxyribonukleotidy a pak je již snadné odečíst primární strukturu původního řetězce.
Za vývoj metody, umožňující stanovení sekvence deoxynukleotidů v DNA, získali roku 1980 F.Sanger a W.Gilbert Nobelovu cenu.