angl. sequence homology, vzájemná podobnost
primární struktury určitých bílkovin nebo nukleových kyselin. Lze ji vyjádřit procentovým podílem homologie, udávajícím, kolik procent aminokyselinových nebo nukleotidových zbytků umístěných ve stejném místě řetězce je stejných, nebo alespoň podobných. Odhalování těchto homologií je významné z několika důvodů:
Vysoká homologie funkčně totožných bílkovin (např. cytochromu-c) a zejména rRNA u různých organismů se považuje za důkaz toho, že tyto druhy jsou vývojově příbuzné.