integrální transmembránové bílkoviny obvykle oligomerní povahy, které zajišťují selektivní aktivní transport iontů; v užším slova smyslu se tím často míní pouze primární aktivní transport, který zajišťují enzymy ze skupiny ATPas. Nejvýznamnější iontovou pumpou je Na,K-ATPasa; podobně fungují i iontové pumpy, zajišťující např. transport vodíkových protonů do prostoru žaludku, čímž zde výrazně snižují
hodnotu pH, nebo vápenatých iontů z cytosolu do endoplasmatického retikula.