obor biochemie, snažící se identifikovat všechny bílkoviny, které jsou v dané buňce (tkáni) přítomny, a vysvětlit, jakou funkci za daných fysiologických nebo pathologických podmínek
plní. Dominantními metodami proteomiky jsou dvojrozměrná elektroforesa (obvykle spojení isoelektrické fokusace a SDS-PAGE) a hmotnostní spektrometrie. Za vývoj nedestruujících ionisačních metod pro hmotnostní spektrometrii biologických
makromolekul získali roku 2002 J.B.Fenn a K.Tanaka Nobelovu cenu.