Izolace a charakterizace biomakromolekul 2023/2024 B320010 2023/2024

Topic outline

• Select topic General

  General

  Collapse all Expand all

  IZOLACE A CHARAKTERIZACE BIOMAKROMOLEKUL

  Rozsah: 2/0 Zk

  Vyučující: doc. Ing. Petra Lipovová, PhD.

  Předmět navazuje na: Biochemie, Enzymologie

  Doporučená literatura: Dr. Ing. K. Bílková, Prof. Ing. B. Králová, CSc.: Izolace biomakromolekul, Vydavatelství VŠCHT, 1997

  
  

  Předmět je zaměřen na pochopení principu purifikačních technik používaných při izolaci biomakromolekul. Cílem je naučit posluchače navrhnout správný purifikační postup pro cílovou biomakromolekulu a charakterizovat ji. Tyto vědomosti naleznou uplatnění v mnoha oborech.

  
  

  Obsah předmětu:
  Úvod - zdroje enzymů, dezintegrace, membránové procesy
  Srážení, extrakce a centrifugace
  Základní rozdělení a instrumentace
  Hydrofobní chromatografie a chromatografie na reversní
  Tenkovrstvá chromatografie, sledování průběhu chromatografie a stanovení koncentrace bílkovin
  Gelová permeační chromatografie, Ionexová chromatografie
  Afinitní chromatogrefie + příprava rekombinantních proteinů
  Úvod do elektroforetických metod
  Typy elektroforetických metod  
  Cvičení – práce s programem protNLab
  Cvičení – navržení postupu přípravy rekombinantního proteinu

  
  

  • Select activity Oznámení

    

    Oznámení Forum
• Select topic Topic 1

  Topic 1
  • Select activity Úvod, zdroje, membránové procesy

    

    Úvod, zdroje, membránové procesy File

    Uploaded 16/09/21, 14:10
• Select topic Topic 2

  Topic 2
  • Select activity Srážení, extrakce, centrifugace

    

    Srážení, extrakce, centrifugace File

    Uploaded 22/09/21, 20:30
• Select topic Topic 3

  Topic 3
  • Select activity Chromatografické metody základní rozdělení a instrumentace

    

    Chromatografické metody základní rozdělení a instrumentace File

    Uploaded 30/09/21, 07:17
• Select topic Topic 4

  Topic 4
  • Select activity Chromatografie I

    

    Chromatografie I File

    Uploaded 20/10/21, 17:11
• Select topic Topic 5

  Topic 5
  • Select activity Chromatografie III

    

    Chromatografie III File

    Uploaded 20/10/21, 17:13
• Select topic Topic 6

  Topic 6
  • Select activity Rekombinantní proteiny

    

    Rekombinantní proteiny File

    Uploaded 26/10/23, 07:46
• Select topic Topic 7

  Topic 7
  • Select activity Elektromigrační metody I

    

    Elektromigrační metody I File

    Uploaded 17/02/22, 12:12
• Select topic Topic 8

  Topic 8
  • Select activity Elektromigrační metody II

    

    Elektromigrační metody II File

    Uploaded 17/02/22, 12:13
• Select topic Téma 9

  Téma 9
  • Select activity Imunochemické metody I

    

    Imunochemické metody I File

    Uploaded 28/11/22, 11:41
• Select topic Topic 10

  Topic 10
  • Select activity Imunochemické metody II

    

    Imunochemické metody II File

    Uploaded 28/11/22, 11:42
• Select topic Topic 11

  Topic 11
  • Select activity Cvičení - příprava rekombinantních proteinů

    

    Cvičení - příprava rekombinantních proteinů File

    Uploaded 8/12/22, 11:57
  • Select activity Zadání - neznámá sekvence

    

    Zadání - neznámá sekvence File

    Uploaded 8/12/22, 07:18
  • Select activity Seznam webových stránek používaných v tomto cvičení

    

    Seznam webových stránek používaných v tomto cvičení Page
  • Select activity neznamá sekvence 2

    

    neznamá sekvence 2 File

    Uploaded 8/12/22, 07:49
• Select topic Téma 12 - Úkol

  Téma 12 - Úkol
  • Select activity Zadání sekvencí 2023

    

    Zadání sekvencí 2023 Folder

    Zde má každý z vás zadaný úsek DNA, který obsahuje jeden gen.

    Not available unless: You belong to Studenti 2023-24
  • Select activity sekvence plasmidu pET19b

    

    sekvence plasmidu pET19b Folder

    Not available unless: You belong to Studenti 2023-24
  • Select activity 2023/24 Návrh primerů pro přípravu vektoru k produkci rekombinantního proteinu

    

    2023/24 Návrh primerů pro přípravu vektoru k produkci rekombinantního proteinu Workshop

    V sekvenci, která vám byla přidělena najděte gen, který obsahuje, a identifikujte jaký protein kóduje.  Dále máte za úkol navrhnout sadu primerů, pomocí kterých daný gen vložíte do plasmidu pET19b tak, aby produkovaný protein měl na N-konci histidinovou kotvu. K vložení použijte dvě metody - pomocí restrikčních endonukleas (při výběru dbejte na to, aby výsledný protein byl co nejméně modifikován) a Gibson assembly (vektor i inzert připravte pomocí PCR).

    Poznámka: Kdo má s touto prací již zkušenosti, může si úkol udělat samostatně, kdo ne, což je asi většina, tak to bude předmětem cvičení 2.11.2023. Úkol bude řešen formou Workshopu, kdy vám 30.11.2023 bude náhodně přidělen opravovač. Splnění obou úloh (vypracování svého zadání i oprava spolužákova) bude podmínkou udělení známky. Vysvětlím na přednášce.

    Not available unless: You belong to Studenti 2023-24
  • Select activity DOTAZNÍK

    

    DOTAZNÍK Feedback
  • Select activity Chcete abych zkontrolovala váš úkol?

    

    Chcete abych zkontrolovala váš úkol? Feedback
• Select topic Topic 13

  Topic 13
  • Select activity Práce s programem ProtNlab

    

    Práce s programem ProtNlab File

    Uploaded 15/11/18, 06:50
  • Select activity Příklady

    

    Příklady File

    Uploaded 28/12/23, 20:05
• Select topic Téma X

  Téma X

  Not available