Moderní metody molekulového modelování
Osnova témat
-
-
Kurz bude zaměřen na moderní metody molekulového modelování, především na numericky nákladné molekulové modelování, pro které je výhodné použití masivní paralelizace umožněné grafickými jednotkami GPU.
-
-
-
Úvod do molekulového modelování
-
Molekulové simulace v základním stavu
- molekulová dynamika
- ab initio molekulová dynamika pomocí dráhových integrálů
- nukleární kvantové efekty
- metody metadynamiky, analýza trajektorií
-
Molekulové simulace v excitovaném stavu
- kvantově chemické metody pro popis elektronově excitovaných stavů
- semiempirické metody
- neadiabatická dynamika pomocí
- výpočty spin-orbitální vazby
-
Spektroskopie a molekulové vlastnosti
- výpočty elektronových spekter
- výpočty vibračních spekter a jejich analýza, výpočty molekulových vlastností ze spekter
- výpočty ionizovaných stavů, metody pro popis solvatace
- vlastnosti solvatovaných molekul
- vizualizace molekulových vlastností