pátek, 10. května 2024, 19.54
Stránky: E-learning VŠCHT Praha
Kurz: Biochemický slovník (Biochemický slovník)
Slovník: Biochemický slovník
P
proteasomtéž proteosom, angl. proteasome, bílkovinný komplex v cytosolu eukaryotních buněk, který selektivně proteolyticky degraduje (EC 3.4.25.1) bílkovinné molekuly označené
ubiquitinem. Při této exergonické reakci se štěpí ATP a získaná energie je využita pro rozbalení (isomeraci) štěpené bílkoviny (EC 5.6.1.5). |
proteasyangl. proteases, enzymy ze třídy
hydrolas (EC 3.4.-.-), které štěpí peptidové vazby v bílkovinách. Neexistuje jasné rozhraní mezi proteasami a peptidasami. Podle katalytických skupin v aktivním místě dělíme proteasy na serinové (rozhodující je hydroxylová skupina serinu, např. trypsin, thrombin), aspartátové (skupina –COO-, např. pepsin), cysteinové (–SH, papain) a metaloproteasy (často Zn2+, karboxypeptidasa). |
proteinasyangl. proteinases, podskupina
proteas (EC 3.4.21.-; EC 3.4.22.-; EC 3.4.23.-; EC 3.4.24.-) štěpící bílkoviny uvnitř peptidového řetězce (viz endopeptidasy). Protože většina proteas jsou endopeptidasy, používá se někdy pojem proteinasa místo obecnějšího proteasa. |
proteinfosfátfosfatasytéž fosfoproteinfosfatasy, někdy méně přesně proteinfosfatasy, angl. phosphoprotein phosphatases, (EC 3.1.3.16), enzymy ze třídy
hydrolas, které odštěpují fosfátovou skupinu z bílkovin (viz fosfatasy). Podílejí se na jednom z nejdůležitějších způsobů regulace aktivity enzymů, spočívajícím na jejich chemické modifikaci připojením (viz proteinkinasy) a odštěpením fosfátové skupiny. Za objevy týkající se fosforylace bílkovin jakožto regulačního mechanismu získali v roce 1992 E. H. Fischer a E. G. Krebs Nobelovu cenu. |
proteinkinasyangl. proteinkinases, enzymy ze třídy
transferas (viz kinasy), které fosforylují bílkoviny přenosem fosfátové skupiny z ATP. Modifikují postranní řetězce serinu, threoninu (Ser/Thr-proteinkinasy, EC 2.7.11.-), tyrosinu (Tyr-proteinkinasy, EC 2.7.10.-) nebo méně často histidinu (His-proteinkinasy, EC 2.7.13.-). Srov. proteinfosfátfosfatasy. |
proteiny asociované s mikrotubulyzkr. MAPs, angl. Microtubule-Associated Proteins, bílkoviny regulující sestavování a stabilitu mikrotubulů. |
proteiny konzervativnítéž konzervované, angl. conservative proteins, bílkoviny, jejichž pořadí aminokyselin se během evoluce ve srovnání s ostatními bílkovinami jen velmi málo mění. Vyplývá z toho, že jejich struktura je tak dokonale přizpůsobena jejich funkci a je pro život buňky (organismu) tak zásadní, že většina změn v primární struktuře není slučitelná se životem (je letální). K známým příkladům patří histony nebo ubiquitin. |
proteoglykanyangl. proteoglycans, glykoproteiny, v nichž hmotnostně převažuje sacharidová složka. Významnými představiteli této skupiny jsou komplexy tvořené mukopolysacharidy a bílkovinami v extracelulárním prostoru pojivové tkáně. |
proteolýzaangl. proteolysis, hydrolytické štěpení
peptidových vazeb bílkovin. Termín je používán v několika souvislostech:
|
proteomikaangl. proteomics, obor biochemie snažící se identifikovat bílkoviny (nejlépe všechny), které jsou v dané buňce (tkáni) přítomny, a vysvětlit jejich funkci za daných fyziologických nebo patologických podmínek. Dominantními metodami proteomiky jsou dvojrozměrná elektroforéza (obvykle spojení isoelektrické fokusace a SDS-PAGE) a hmotnostní spektrometrie. Za vývoj nedestruujících ionizačních metod pro hmotnostní spektrometrii biologických makromolekul získali roku 2002 J. B. Fenn a K. Tanaka Nobelovu cenu. |