podle separačního principu: chromatografie
a) adsorpční (látky se na stacionární fázi adsorbují),
b) rozdělovací (stacionární fází je kapalina, zachycená na pevný nosič, dochází tak k rozdělení mezi dvě nemísitelné kapaliny,
např. viz
chromatografie papírová),
c) iontoměničová (stacionární fází je ionex, s nímž dělené látky, především ionty, interagují elektrostaticky),
d) s hydrofobní interakcí (stacionární fáze má nepolární charakter a dělené látky s ní interagují prostřednictvím hydrofobních interakcí),
e) gelová permeační (stacionární fázi tvoří gel s póry o určitém průměru, látky se dělí podle velikosti a tvaru molekul);
f) bioafinitní (využívá se specifické interakce molekul). Často se uplatňuje více těchto principů při jednom chromatografickém uspořádání.