proces, při němž je imunitní odpověď organismu vyvolána jeho vlastními komponentami. Tímto mechanismem např. organismus rozpoznává
některé své starší buňky, které byly delším pobytem v organismu pozměněny a vznikly na nich „nové“ antigenní determinanty. Často se však jedná o pathologický proces; některé autoimunní choroby jsou vyvolány tím, že imunitní systém organismu likviduje své vlastní funkční buňky.